在南头岛的腹地，有一座历史悠久的古城池——南头古城。该城建于明洪武二十七年（1394年）。在深圳建市15年之际，正好是南头古城700年大庆。据深圳市文化局1984年的调查测量得知：南头古城旧址呈不规则的长方形，四周有濠沟围绕。城址范围西最长距离为680米，南北最宽处为500米。城址用山岗黄泥砂土堆筑，现南北城墙尚存基址。唯南城门保存完好。南门城址底宽10米，高4米半，城楼已毁。拱形城门上有一块长方形石块，上用小篆阴刻“宁南”二字。

古朴雄伟的南头古城，是岭南古文化的宝贵遗存，它经历并记录了深圳、南头地区的历史风云。南头城历史悠久，几经变迁，今天已成为深圳市南山区的政治、经济、商贸、文化中心。